Q:柱子上面的墊片實(shí)驗(yàn)前是否要取出?
A:不用取出
Q:實(shí)驗(yàn)?zāi)康臑槌ザ怪形唇Y(jié)合的酶,NI-NTA His Bind Resin是否適用?
A:不推薦
Q:如何配置破菌緩沖液:
A:1 L 體積
Tris 20 mM (6M HCl調(diào)pH值到7.4) 2.42 g
NaCl 250 mM 14.6 g
PMSF 1 mM 10 mL 100X 儲(chǔ)液
100X PMSF 儲(chǔ)液(1.74 g PMSF 溶解于100 mL異丙醇), -20℃長(zhǎng)期保存,4℃保存數(shù)月,禁止室溫存放
Q:如何配置上樣緩沖液:
A:同破菌緩沖液,可以不加PMSF
Q:如何配置洗雜緩沖液:
A:在上樣緩沖液中添加咪唑至20 mM
Q:如何配置洗脫緩沖液:
A:在上樣緩沖液中添加咪唑至200 mM
Q:目的蛋白不同,緩沖液一樣的配方?
A:上述緩沖液為起始緩沖液,目的蛋白質(zhì)不同,可能需要不同的純化緩沖液。具體使用可以參考分子克隆等工具書或者文獻(xiàn)對(duì)緩沖液做修改。也可以根據(jù)蛋白質(zhì)性質(zhì)對(duì)上述緩沖液做修改
Q:凍融如何做,反復(fù)凍融幾次:
A:從-80°拿出來,再放進(jìn)去反復(fù)凍融至少3次
Q:目的蛋白質(zhì)在PH7.4下不穩(wěn)定:
A:可以在pH7.3-8.3的范圍內(nèi)對(duì)緩沖液的pH調(diào)整
Q:200 mM咪唑未洗脫下目的蛋白質(zhì):
A:可以繼續(xù)提高咪唑濃度
Q:洗雜蛋白時(shí)目的蛋白質(zhì)也洗脫:
A:加5%甘油,0.1% tritonX100,0.5M NaCl可能會(huì)有效果,起到以下兩個(gè)作用:
(1)減少非特異吸附:甘油,去垢劑(triton),NaCl 都可以減少蛋白間疏水作用降低非特異吸附, 使雜蛋白更容易洗脫;
(2)通過減少蛋白間疏水作用使HIS-tag暴露的更加靈活,與Ni結(jié)合的更緊密,不容易被洗脫。
還有一種方法即洗雜緩沖液中咪唑濃度降低或者不添加
Q:如何再提高蛋白質(zhì)純化的效果:
A:一些情況下,緩沖液中添加5%-10%的甘油,0.1%的tween,0.5M的NaCl會(huì)提高蛋白質(zhì)純化的效果。
Q:破菌時(shí)可以用EDTA做蛋白酶抑制劑嗎
A:可以適當(dāng)加入PMSF作為蛋白酶抑制劑,但是不能使用EDTA。
Q:破菌時(shí)可以用DTT做還原劑嗎
A:還原劑使用2 mM 2-ME,避免使用DTT,因?yàn)镈TT會(huì)造成Ni/Co離子還原
Q:破菌緩沖液可以用PBS嗎
A:可以
Q:我購買的是1ml預(yù)裝柱,十倍柱體積平衡是指10ml上樣緩沖液平衡嗎
A:是
Q:一個(gè)過程下來需要多長(zhǎng)時(shí)間?正常流速每秒多少滴
A:重力柱,一般1s流速50ul左右
機(jī)械柱可以儀器調(diào)節(jié),一般跟重力柱比可以快50-100%
Q:如果流速過慢,怎么處理
A:可以使用硅膠管控制上樣速度。或預(yù)裝柱下面接軟管,再接蠕動(dòng)泵
Q:正常流速過一次柱就可以充分結(jié)合了嗎?是否需要多過幾次柱?
A:一次就可以,如果流速過快,可以再過一次
Q:上樣完成后,是否可直接進(jìn)入洗雜步驟
A:樣品上完以后,使用上樣緩沖液洗柱10個(gè)柱體積,注意將純化柱側(cè)壁上的殘留樣品洗干凈。
Q:如何洗去雜蛋白
A:使用10-20倍柱體積洗雜緩沖液將雜蛋白從純化柱上洗去,如果雜蛋白太多可以加大洗雜體積。
Q:如何判定洗雜步驟已經(jīng)完成
A: 一般10個(gè)柱體積即為洗雜步驟完成。
Q:雜帶多,雜蛋白洗不掉怎么辦
A:增加咪唑濃度,若仍無好轉(zhuǎn),嘗試下:洗雜液中添加NaCl到150mM【Nacl濃度最高不要超過500mM】,TritonX100到1%【作用去掉柱料的一些非特異性吸附】,甘油到5%
Q:如何洗脫目的蛋白
A:洗雜結(jié)束以后,使用4-10倍柱體積洗脫緩沖液將目標(biāo)蛋白洗脫。通常目標(biāo)蛋白會(huì)在第二個(gè)柱體積中開始流出。
Q:難以洗脫目的蛋白
A:難以洗脫的蛋白最高可用咪唑濃度500mM,或者EDTA連同鎳離子一起洗脫(不得已的辦法)。
Q:如何判斷收集的液體中有目的蛋白
A:收集液中的目的蛋白質(zhì)用SDS-PAGE檢測(cè)。
Q:純化完成后如何處理柱子/保存柱子
A:收集完成以后,使用8M尿素或者6M鹽酸胍5倍柱體積洗柱,再使用大量蒸餾水水洗柱,封閉純化管上下兩端保存在4 ℃,不要在-20 ℃凍結(jié)。如果長(zhǎng)期不用,加入5 ml 20%乙醇封閉保存。
Q:哪些情況下需要鎳柱重生
A:His?Bind Resin可以多次使用,不需要再生。如果需要使用一根柱子純化不同目標(biāo)蛋白,或者長(zhǎng)時(shí)間使用造成金屬離子脫落,柱子堵塞、流速慢,可以按照下述方法進(jìn)行再生。
Q:如何重生
A:1. 用0.1 M EDTA洗柱4倍柱體積,將金屬離子洗脫下來,再用蒸餾水洗柱10倍柱體積除去EDTA殘留。
2. 使用0.2 M醋酸洗柱4倍柱體積,10倍柱體積蒸餾水沖洗,再用0.1M 氫氧化鈉洗柱4倍柱體積, PBS/TBS平衡pH,大量蒸餾水洗柱。這一步需要避免強(qiáng)酸、強(qiáng)堿洗柱時(shí)間過長(zhǎng)。
3. 用4%氯化鎳或者硫酸鎳3倍柱體積重新螯合10分鐘,也可以使用4%氯化鈷或者硫酸鈷螯合柱子。
4. 柱子長(zhǎng)時(shí)間不用,加入20% 乙醇,封口后于4攝氏度保存,避免干裂或者凍結(jié)。
Q:可以重復(fù)用多少次
A:10-20次
Q:重生后效果如何?與初始狀態(tài)相比可以達(dá)到多少?
A:重復(fù)性≥95%
Q:堵柱嚴(yán)重,怎么辦
A:如果柱子堵塞嚴(yán)重,重生時(shí)使用1% Triton X-100/PBS浸泡過夜。
Q:螯合鎳時(shí)間太長(zhǎng),有時(shí)一天,是否會(huì)影響效果
A:沒有影響
Q:使用過程中發(fā)現(xiàn)堵塞嚴(yán)重,且流速越來越慢
A:樣品處理過程中,高速離心,最好用0.45um的濾膜過濾(推薦)
如果柱子堵塞嚴(yán)重,重生時(shí)使用1% Triton X-100/PBS浸泡過夜。
流速慢,可再柱子下面接一根軟管。
Q:如何保存
A:20%乙醇保存;4℃保存,1年有效。
Q:是否必須冰上操作?常溫是否可以?
A:在未知Ni-NTA His?Bind Resin融合蛋白穩(wěn)定性的情況下,整個(gè)純化過程最好在4℃完成
Q:是否可以用EDTA
A:可以使用蛋白酶抑制劑防止降解,但是EDTA應(yīng)當(dāng)在純化完成以后再加入。
Q:是否可以使用非離子去垢劑改善結(jié)合?具體濃度?
A:可以,具體使用濃度參考以下:1% Triton X-100,1% Tween-20,0.03% SDS,0.1% NP-40。
Q:購買的1ml預(yù)裝柱可以結(jié)合多少蛋白
A:每根1 ml的His?Bind Resin親和柱一次可以結(jié)合大約20 -30 mg His-tag融合蛋白
Q:我們的樣品種類較多,可以用同一根柱子嗎
A:最好不同的融合蛋白使用不同的柱子,樣品較多,可以使用多根柱子,或者純化完一種樣本后需重生后再純化另外一種蛋白。
Q:有哪些方法可以減少雜蛋白的結(jié)合
A:上樣緩沖液中可以含有1 mM咪唑減少雜蛋白的結(jié)合
Q:我的目的蛋白在咪唑20mM時(shí)就掉下來了
A:部分目標(biāo)蛋白會(huì)在20 mM咪唑洗雜緩沖液中流出,所以對(duì)于新樣品,每一步都要留樣電泳,摸索純化條件。
Q:我的目的蛋白是包涵體形式,如何變性
A:如果融合蛋白是包涵體形式,那么可以選擇變性純化方法,通常是在緩沖液中加入8M 尿素以及去垢劑。變性純化時(shí)一定要做好樣品處理,不然容易造成柱子堵塞。
Q:變性后的蛋白如何處理
A:變性方法得到的蛋白一般沒有活力,可以用來制備抗體,但如想測(cè)定活力,就需要做復(fù)性。
Q:變性蛋白如何復(fù)性
A:蛋白質(zhì)復(fù)性方法有很多種,稀釋法、透析法、離子交換復(fù)性法,分子篩復(fù)性法,自己選擇合適的方法來做。
Q:除了可以咪唑洗脫,還有其他方法可以洗脫嗎
A:除了常規(guī)的咪唑洗脫方法以外,還有EDTA洗脫和pH梯度洗脫。后兩種方法缺點(diǎn)明顯,只在特殊情況下使用。
Q:去除his 標(biāo)簽的方法
A:可以使用在柱酶切的方法得到去除His-tag的目標(biāo)蛋白。經(jīng)常使用的酶包括:Thrombin;Enterokinase;TEV protease等。我們推薦TEV protease(貨號(hào):RPP002),因?yàn)檫@種酶的特異性較好,是帶有Ni-NTA His?Bind Resin的重組酶,方便除去。在柱酶切可以提高產(chǎn)物純度,但是空間位阻可能造成酶切效果不好,按照慣例,多數(shù)實(shí)驗(yàn)不用切除Ni-NTA His?Bind Resin。
Q:金屬離子脫落,柱子失去顏色或者變色
A:確證破菌緩沖液中不含有EDTA、EGTA、檸檬酸、DTT等螯合劑;重新處理柱子,為His-Binding-resin螯合金屬離子。
Q:融合蛋白是包涵體
A:降低表達(dá)溫度(16-22℃),降低IPTG誘導(dǎo)濃度(10-100 μM),縮短誘導(dǎo)時(shí)間(2-5小時(shí));做包涵體復(fù)性,或者使用變性純化。
Q:表達(dá)量太低
A:換載體或者優(yōu)化密碼子序列。
Q:融合蛋白不結(jié)合
A:測(cè)序檢查核酸序列,將tag從一端移到另一端,增加接頭序列。
Q:純化的蛋白沒有活性
A:調(diào)整破菌條件,超聲產(chǎn)生的熱量可能使GST蛋白變性。
Q:融合蛋白被蛋白酶降解
A:在破菌緩沖液中加入蛋白酶抑制劑,縮短純化時(shí)間,降低溫度。
Q:融合蛋白不能從柱子上洗脫
A:加入0.1% TritonX-100;增加NaCl濃度;使用變性純化。
Q:融合蛋白被蛋白酶降解
A:在破菌緩沖液中加入蛋白酶抑制劑,縮短純化時(shí)間,降低溫度。
Q:有些宿主細(xì)胞的分子伴侶蛋白會(huì)與融合蛋白結(jié)合
A:上樣前加入5 mM DTT,或者使用10 mM MgSO4 50 mM Tris,2 mM ATP先反應(yīng)20分鐘,讓伴侶蛋白去結(jié)合。
Q:超聲裂菌過度,目標(biāo)蛋白被打斷
A:注意超聲儀的工作功率以及超聲時(shí)間,使用顯微鏡控制裂菌。
Q:金屬離子親和柱非常容易產(chǎn)生非特異性吸附,特別是在目標(biāo)蛋白表達(dá)量較低時(shí)
A:在上樣緩沖液中加入去垢劑,可以有多種選擇;加大目標(biāo)蛋白上樣量;減少bead使用量;加大鹽離子濃度;咪唑梯度洗脫;變性純化等等。
Q:PMSF是否可以不加
A:PMSF為蛋白酶抑制劑,作用是防止目的蛋白被降解,可以不加
Q:破菌液中加咪唑嗎
A:可以不加,如一定要加,建議可以加1-5mM,加了會(huì)競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合,減少雜蛋白的結(jié)合,增加雜蛋白的穿出
Q:重復(fù)使用,效率不高,怎么辦
A:在第一次使用后,處理一下“8mol 尿素 沖洗(1ml鎳柱對(duì)應(yīng)20ml尿素),用水沖洗干凈尿素,上0.1mol 硫酸鎳 (1ml鎳柱對(duì)應(yīng)1ml硫酸鎳)”,然后再進(jìn)行后面的操作
Q:柱子上面的墊片實(shí)驗(yàn)時(shí)是否需要取出,墊片是什么作用
A:不要取出,墊片的作用:1、擋住臟東西;2、防止膠飄起來
Q:結(jié)合不到蛋白或結(jié)合力弱
A:1. Binding buffer(或者細(xì)胞裂解buffer)
咪唑濃度不要超過5mM,NTA和HIS-Tag的結(jié)合力較弱所以最好不加咪唑,先把蛋白binding上去再洗雜蛋白;
PH中性或偏堿(PH 7.0-8.5)酸性條件下蛋白很難和鎳柱結(jié)合;
buffer中不要有EDTA(可以螯合鎳),DTT等還原劑(可以還原鎳)。
2. 蛋白特性
蛋白折疊后his-tag被包裹在內(nèi)部,無法暴露出來與鎳柱結(jié)合; 可以嘗試在蛋白中加入變性劑尿素(2M-8M)在部分或完全變性 的條件下純化蛋白。
Q:不掛柱
A:不掛柱現(xiàn)象在蛋白純化實(shí)驗(yàn)中較為常見,通常與蛋白表達(dá)狀態(tài)、實(shí)驗(yàn)體系等因素相關(guān),填料本身一般不構(gòu)成該問題的主要原因。可嘗試優(yōu)化實(shí)驗(yàn)方案或重新構(gòu)建克隆。
Q:來源于哪些表達(dá)系統(tǒng)的His蛋白有很好的純化效果(原核?真核?例如桿狀病毒/哺乳細(xì)胞/酵母/細(xì)菌等)
A:只要目的蛋白質(zhì)帶His標(biāo)簽都可以用鎳柱純化,注意分泌表達(dá)的蛋白質(zhì),如果培養(yǎng)基中含有復(fù)雜的成分,其中可能含有還原劑或螯合劑,此時(shí)培養(yǎng)基上清不能直接用鎳柱純化,應(yīng)當(dāng)先將培養(yǎng)基脫鹽處理再上柱純化。
Q:蛋白量少,推薦用多大規(guī)格的預(yù)裝柱
A:正常20mg/ml的載量,推薦小規(guī)格預(yù)裝柱
Q:上清渾濁,是用IDA好還是NTA好
A:上清渾濁,推薦適當(dāng)稀釋上清,并在此離心或者過0.45um濾膜處理。IDA或NTA都可純化。
Q:如何自己裝柱(重力柱)
A:參考裝柱說明,詳詢請(qǐng)咨詢技術(shù)人員
Q:蛋白大小27KD,是否可用我們的鎳柱
A:可以
Q:預(yù)裝柱純化過程中,流速越來越慢,除了加硅膠管,還有什么方法
A:推薦再生柱料。
Q:我在純化時(shí)變性緩沖液里加入巰基乙醇,對(duì)鎳柱是否有影響?如果不用巰基乙醇會(huì)有什么影響?
A:不加是沒有影響的,不過有些蛋白可能會(huì)出現(xiàn)沉淀的情況,這個(gè)要看蛋白特性。巰基乙醇濃度不要超過10mM,或者5mM DTT
Q:如果表達(dá)蛋白中含有半胱氨酸沒有二硫鍵,在純化時(shí)是否需要加還原劑保護(hù),一般用多大濃度
A:可以不加還原劑,不加還原劑可能會(huì)有20%-30%二硫鍵。如果要全部游離狀態(tài)的話,可以加1mM DTT
Q:純化率達(dá)到多少?
A:大部分蛋白可達(dá)到95%以上,特殊蛋白情況不定,尤其是包涵體蛋白,可能達(dá)不到95%
Q:生物酶是否可以用鎳柱純化
A:可以
Q:洗雜蛋白時(shí),咪唑加到40mM,目的蛋白就會(huì)掉下來,20-30mM雜蛋白又總洗不掉,反復(fù)做了幾次,始終收不到想要的蛋白,請(qǐng)問有什么建議嗎?
A:20mM洗雜蛋白,洗雜緩沖液中添加NaCl 0.5M,甘油10%,triton X-100 0.5%。 50mM洗脫目的蛋白質(zhì)。
Q:1ml可以加多少蛋白液(菌液)?
A:1mL預(yù)裝柱載量可以達(dá)到10mg,根據(jù)表達(dá)的蛋白質(zhì)的量來決定上樣體積。
Q:融合蛋白鎳柱純化有雜帶,目標(biāo)蛋白量不算小,但雜帶很明顯。排除目的蛋白被降解的可能。
A:緩沖液中NaCl 0.5M,甘油10%,triton X-100 0.5%。 來降低非特異性結(jié)合。
Q:柱子中有大氣泡,且排不出去。
A:手工重力柱 裝柱時(shí) 有時(shí)里面會(huì)有小氣泡 對(duì)于流速和純化沒有影響
如果影響到了流速和純化效果的話,可以加3/4柱體積的 20%乙醇 然后用1ml槍頭將上面的篩片撥動(dòng) 重新裝一下上面的篩片即可
Q:包涵體蛋白,尿素變性后怎么做
A:1. 破菌離心收集包涵體沉淀。
2. 包涵體沉淀用含1%的Triton-100,超聲重懸。再離心收集沉淀。
3. 選作,步驟2再重復(fù)一遍。
4. 包涵體沉淀用6M (如果6M不溶,補(bǔ)加尿素到8M)重溶,短暫超聲可以輔助包涵體溶解。
5. 離心,去掉不溶的沉淀。
6. 配置復(fù)性緩沖液:含5mM GSH,0.5mM GSSG,10%甘油的PBS或者TBS
7. 復(fù)性緩沖液預(yù)冷到0-4℃,電磁攪拌旋轉(zhuǎn)下,將6M尿素中的變性蛋白,慢慢滴加到復(fù)性緩沖液中。按照1體積的變性蛋白質(zhì),20-100體積的復(fù)性緩沖液的體積比稀釋。
8. 繼續(xù)攪拌1小時(shí)。
9. 選作,4℃靜置過夜。
10. 選作,離心去除未變性的蛋白質(zhì)。如果純重力上樣,推薦做此步,防止柱子堵塞不流。
11. 復(fù)性蛋白質(zhì)上NTA-鎳柱純化。
若做的是包涵體蛋白,推薦用NTA-鎳柱(變性液可以直接過柱),不可用IDA-鎳柱,復(fù)性后蛋白會(huì)破壞IDA鎳柱
Q:要用鎳柱做實(shí)驗(yàn),樣品大于55kd,為包涵體,原核表達(dá)的?
A:可以用6M鹽酸胍變性,然后用帶8M尿素的緩沖液(鎳柱純化全程)
樣品用6M脲變性溶解后,緩沖液也是相同條件,然后用咪唑梯度洗脫即可。
8M脲有點(diǎn)高了,而且不好溶解;6M胍溶液太稠了,溶液流的太慢了(如果用機(jī)器,壓力就會(huì)太大)。
Q:1.原核表達(dá)蛋白時(shí)如何增加目的蛋白表達(dá)量?乳糖取代IPTG效果是否明顯?2.若目的蛋白為包涵體,如何增加最后復(fù)性得率?是先復(fù)性?還是先純化?3.目的蛋白易降解,在表達(dá)、純化和儲(chǔ)存方面需要注意事項(xiàng)
A:1. 原核表達(dá)蛋白質(zhì)增加蛋白量需要摸索條件,乳糖替代IPTG誘導(dǎo)有時(shí)候表達(dá)量增加有時(shí)候減少。一般規(guī)律是如果不容易降解的重組蛋白質(zhì)增加誘導(dǎo)時(shí)間會(huì)增加表達(dá)量,容易降解不穩(wěn)定的蛋白質(zhì)需要摸索一個(gè)誘導(dǎo)時(shí)間,誘導(dǎo)時(shí)間過長(zhǎng)會(huì)造成蛋白質(zhì)降解,表達(dá)量降低。
2. 包涵體復(fù)性液需要摸索不同的復(fù)性方法和復(fù)性緩沖液。一般推薦先復(fù)性再純化。
3. 目的蛋白質(zhì)容易降解,一般需要降低表達(dá)時(shí)候的溫度,摸索一個(gè)合適的誘導(dǎo)時(shí)間,純化時(shí)在低溫條件下進(jìn)行,純化時(shí)間要快,盡量誘導(dǎo)結(jié)束,盡快收菌、破菌、上柱純化。純化后的蛋白質(zhì)保存嘗試DTT、甘油等保護(hù)劑,在-80℃保存。
Q:上樣后剛開始慢慢滴,沒一會(huì)就不滴了,是否可以用洗耳球加壓,控制1s一滴,會(huì)不會(huì)太快。
A:這個(gè)情況是正常的,可以用洗耳球,但是這樣做工作量太大,太累。建議:
1. 12000rpm 離心10min,如果還是比較渾濁,再離心一次。
2 或者0.45um濾膜過濾一下。
Q:蛋白裂解液粘稠該如何處理
A:裂解液粘稠是流不下來的,建議①在超聲儀上做超聲,打斷核酸,裂解液會(huì)變清亮不粘稠,若是包涵體蛋白,達(dá)不到清亮但不會(huì)粘稠②反復(fù)凍融,有好轉(zhuǎn),效果沒做超聲好③加入全能核酸酶
Q:第一遍過柱速度慢,不接軟管的情況下可以如何調(diào)整加快流速。
A:樣品稀釋,降低粘稠度。
Q:最后一步用8M尿素或鹽酸胍洗柱是否一定要做,加尿素的作用是什么?
A:不是必須步驟,但若不洗,后續(xù)純化會(huì)有雜蛋白。加尿素可以使蛋白變性,非特異性結(jié)合的蛋白洗下來。
Q:如何洗去咪唑
A:用水大量沖洗
Q:顏色很淡,會(huì)不會(huì)影響效果?需要重新螯合Ni嗎
A:不影響效果,不用重新螯合。
Q:鎳柱顆粒大小是多少
A:65-160um
Q:未能純化到His標(biāo)簽蛋白?
A:建議先確認(rèn)是否為蛋白沒有掛柱直接流穿?還是蛋白未被洗脫下來?若排除這兩點(diǎn),我們還總結(jié)了以下因素,建議您一一排除:
1、Q:超聲功率不對(duì)
A:超聲前加入溶菌酶,改變超聲功率
2、Q:樣品或者結(jié)合緩沖液不對(duì)
A:檢測(cè)PH及樣品盒結(jié)合緩沖液的組成份。保證溶液中的螯合劑或強(qiáng)還原劑濃度及咪唑的濃度不高。
3、Q:組氨酸的標(biāo)簽沒有完全的
A:在變性條件下(用4-8M脲,或4-6M鹽酸胍)進(jìn)行純化
4、Q:His標(biāo)簽丟失
A:建議1、檢查His是否表達(dá),上游構(gòu)建,改變His標(biāo)簽的位置(C-terminal or N-terminal),必要時(shí)增加His個(gè)數(shù)(常用6-10個(gè))
建議2、降低流速、增加孵育時(shí)間
建議3、尋找最佳的結(jié)合金屬離子
Ni2+通常是宿主細(xì)胞蛋白中純化大多數(shù)6個(gè)組氨酸標(biāo)記重組蛋白的一般常用金屬離子。蛋白和金屬離子之間的結(jié)合強(qiáng)度受長(zhǎng)度、位置、親和標(biāo)記在蛋白的暴露程度、所用離子的類型、以及緩沖液的PH這幾種因素影響,因此一些蛋白用其他離子可能更容易地進(jìn)行純化而不同Ni2+。
Q:目的蛋白洗脫不下來
1、Q:洗脫條件太溫和(組氨酸標(biāo)記的蛋白質(zhì)仍然結(jié)合在柱上,結(jié)合力較強(qiáng))
A:增加咪唑的梯度或降低PH來找出最佳的洗脫條件。
2、Q:若您選用降低PH的方法洗脫的,PH低于3.5,會(huì)導(dǎo)致鎳離子脫落
A:改變洗脫方法,咪唑競(jìng)爭(zhēng)性洗脫
3、Q:蛋白已沉淀在柱上
A:減少上樣量,或使用咪唑的線性梯度而不是分步洗脫以降低蛋白的濃度。試用去污劑或改變NaCL的濃度,或在變性條件(去折疊)下洗脫(用4-8M脲,或4-6M鹽酸胍)。
4、Q:非特異性疏水或其他相互反應(yīng)
A:洗脫緩沖液中添加非離子去污劑(如2%Triton X-100)或增加NaCL的濃度。
Q:洗脫后雜帶較多,什么原因?如何優(yōu)化?很多天然的蛋白也會(huì)帶有HIS,所以經(jīng)常會(huì)出現(xiàn)HIS標(biāo)簽蛋白洗脫后有一些雜帶
1、Q:蛋白酶部分降解了標(biāo)簽蛋白
A:請(qǐng)?zhí)砑拥鞍酌敢种苿?。(慎用EDTA)
2、Q:雜質(zhì)對(duì)鎳離子有更高的親和性
A:推薦1:優(yōu)化咪唑濃度,以確保宿主細(xì)胞蛋白質(zhì)的低結(jié)合和組氨酸標(biāo)記的目標(biāo)蛋白質(zhì)的強(qiáng)結(jié)合之間的最佳平衡。分步或線性洗脫摸出最優(yōu)的咪唑結(jié)合和清洗濃度;在樣品中加入與結(jié)合緩沖液同樣濃度的咪唑;咪唑的梯度不大(20個(gè)或更多的柱床體積),可能分離出有相似結(jié)合強(qiáng)度的蛋白。
推薦2:篩選適合的緩沖液條件,NaCL濃度,PH的范圍都需要進(jìn)行篩選。
Q:雜質(zhì)和標(biāo)簽蛋白結(jié)合
A:在超聲前加入還原劑或去垢劑;增加去垢劑的濃度,(2%Triton X-100 or2% Tween 20);或者在washing buffer中增加甘油的濃度(50%)減少非特異性的相互反應(yīng)??紤]增加咪唑的濃度或者改變金屬離子。
Q:洗滌不充分
A:增加洗滌的次數(shù)。
Q:蛋白過鎳柱純化的原理
A:鎳可以與有His標(biāo)簽的堿性蛋白結(jié)合。蛋白上樣后,帶有his標(biāo)簽的蛋白特異性結(jié)合到柱子里,雜蛋白流出。鎳也可以與咪唑結(jié)合,咪唑競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合到鎳上,再用咪唑梯度洗脫,目的蛋白就被洗下來了,收集穿出液,里面就是目的蛋白,再透析掉咪唑。
Q:是否需要孵育?還是直接過柱流下來,直接結(jié)合了?
A:直接過柱流下來,鎳柱與蛋白結(jié)合很快,不需要孵育
Q:推薦的線性流速是多少?
A:fast flow正??梢?cm/min,一般推薦0.5cm/min就已足夠(1ml/min)。
Q:柱子不小心干了,怎么處理?填料出現(xiàn)了結(jié)塊
A:可以用20%乙醇或PBS/TBS重懸一下即可。出現(xiàn)結(jié)塊用1ml槍吹散。
Q:蛋白表達(dá)量較低,洗完之后如何濃縮
A:超濾管濃縮
Q:CHO細(xì)胞表達(dá)的蛋白,能否用鎳柱純化
A:只要帶his標(biāo)簽就可以用鎳柱純化。但是蛋白質(zhì)樣品要預(yù)處理一下,引物cho細(xì)胞培養(yǎng)基上清組分比較復(fù)雜,可能影響掛柱。
Q:蛋白樣品如何預(yù)處理
A:各種預(yù)處理方法,比如超濾去除培養(yǎng)基中大部分氨基酸,硫酸銨沉淀,或者透析,這個(gè)是蛋白純化策略問題,不同的樣本量,樣本形式都不一樣。
本產(chǎn)品僅供科學(xué)研究使用,不得用于人體 / 動(dòng)物醫(yī)療、診斷及臨床治療
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