Q:檢測原理
A:細(xì)胞在發(fā)生凋亡時(shí),會在生理生化和細(xì)胞形態(tài)上發(fā)生一系列變化,在凋亡中晚期,激活的DNA內(nèi)切酶會切斷核小體間的基因組DNA,DNA會被降解成為約180bp-200bp 的片段,而正常或者增殖細(xì)胞很少發(fā)生DNA斷裂。利用這個(gè)差異,用脫氧核糖核苷酸末端轉(zhuǎn)移酶(TdT 酶)把Biotin標(biāo)記的dUTP標(biāo)記到斷裂DNA片段的3’-OH 末端,用POD檢測標(biāo)記并用底物顯色,然后進(jìn)行顯微鏡觀察
Q:檢測方法
A:顯微鏡
Q:樣本類型
A:石蠟包埋組織切片、組織冰凍切片、細(xì)胞涂片以及貼壁細(xì)胞
Q:儲存條件
A:試劑盒需儲存在-20℃非無霜冰箱中,避免反復(fù)凍融。建議分裝保存Biotin-標(biāo)記反應(yīng)混合物
Q:自備試劑
A:1.石蠟切片自備試劑:PBS溶液、二甲苯;
濃度梯度分別為70%、80%、90%、100%的乙醇溶液;
每個(gè)樣本需要100μL 20μg/mL的蛋白酶K溶液,用PBS配制;
含0.1% Triton X-100和2mg/mL BSA的PBS溶液;
含3%BSA的PBS溶液(選用步驟)。
2.組織冰凍切片自備試劑:PBS溶液;
含4%多聚甲醛的PBS;
每個(gè)樣本需要100μL 20μg/mL的蛋白酶K溶液,用PBS配制;
含0.1% Triton X-100和2mg/mL BSA的PBS溶液;
含3%BSA的PBS溶液(選用步驟)。
3.固定細(xì)胞片自備試劑:與冰凍組織切片同。
Q:固定樣品需要準(zhǔn)備什么
A:固定樣品,需自備多聚甲醛
Q:Tunel反應(yīng)液配制后用不完可以保存繼續(xù)使用嗎
A:TUNEL反應(yīng)液即用即配,不要配制好后存放
Q:POD反應(yīng)液配制后如何保存
A:POD反應(yīng)液用POD貯液和POD稀釋液即用即配,配制好后可以4℃保存(3個(gè)月),POD可以-20℃保存
Q:我需要檢測石蠟切片,是否需要預(yù)處理
A:如果用于石蠟切片的檢測,需用蛋白酶K,二甲苯處理
Q:如何固定懸浮細(xì)胞
A:懸浮細(xì)胞可用以下方法固定或貼附在玻片上:4°C 緩慢離心(1000rpm)5分鐘,去除細(xì)胞培養(yǎng)上清,并將細(xì)胞重新懸浮在4%的甲醛溶液(溶于1×PBS 溶液)使其終密度為1×106/ml,室溫孵育10 分鐘。按照上述方法離心收集細(xì)胞,去除固定液并用80%乙醇溶液以相同細(xì)胞密度重懸。固定后的細(xì)胞可以保存在4°C。固定后的細(xì)胞(100-300μl)可直接固定在玻片上,使用聚L-賴氨酸包被的玻片可以提高細(xì)胞的黏附性
一、石蠟包埋組織切片處理流程
Q:樣本如何脫蠟
A:1、室溫下將石蠟組織切片放入二甲苯中浸泡5分鐘。更換新的二甲苯再浸泡5分鐘以徹底脫掉石蠟。
2、室溫下用100%乙醇浸泡切片5分鐘,更換新的100%乙醇再浸泡5分鐘。
3、室溫下用梯度乙醇(90、80、70%)各浸洗1 次,每次2分鐘,逐漸增加水分。
4、用PBS 輕輕潤洗切片,并用濾紙小心吸干玻片上樣本周圍多余的液體。這時(shí)可用石蠟筆或疏水筆在樣品周圍描繪樣品分布的輪廓,便于下游透性處理和平衡標(biāo)記操作。
注意:在實(shí)驗(yàn)過程中,切勿讓樣品干燥。處理好的樣本放在濕盒中保持樣本的濕潤
Q:如何增加樣本的通透性
A:1、用PBS溶液配置終濃度為20μg/ml的蛋白酶K(不含DNase活性),每個(gè)樣本需要100μL 蛋白酶K 溶液。
2、每個(gè)樣本上滴加100μL 濃度為20μg/ml 的蛋白酶K溶液,使其被全部覆蓋,室溫孵育20分鐘。
3、用PBS 溶液潤洗樣本三次。
4、輕輕去掉多余液體,并用濾紙小心吸干載玻片上樣本周圍的液體。處理好的樣本放在濕盒中保持樣本的濕潤。
Q:孵育時(shí)間沒有把握好,有沒有影響
A:注意:嚴(yán)格控制孵育時(shí)間,孵育時(shí)間過長可對細(xì)胞造成一定的傷害,過短則可能造成透性處理不充分,影響標(biāo)記效率。蛋白酶K工作液的使用濃度、處理時(shí)間及溫度因組織或細(xì)胞的類型或固定方法的不同而有所不同,使用者可參照試劑盒提供的標(biāo)準(zhǔn)使用說明摸索最合適的實(shí)驗(yàn)條件。
Q:如何配置標(biāo)記反應(yīng)液
A:
| 組分比例 | 1個(gè)樣品 | 10個(gè)樣品 | 20個(gè)樣品 |
| Biotin-標(biāo)記反應(yīng)混合物 | 48 uL | 480 uL | 960 uL |
| TdT 酶(25x) | 2 uL | 20 uL | 40 uL |
| 標(biāo)記反應(yīng)液 | 50 uL | 500 uL | 1000 uL |
Q:標(biāo)記反應(yīng)液用不完能否儲存
A:標(biāo)記反應(yīng)液應(yīng)充分混勻,并且一次用完,不能儲存,所以應(yīng)該酌量配置。
Q:標(biāo)記反應(yīng)
A:1、洗滌樣品一次,輕輕吸干樣本周圍的緩沖液,注意不要觸碰到樣本。
2、在每個(gè)樣本上立即滴加50μl上述準(zhǔn)備的TdT 標(biāo)記反應(yīng)混合物。
3、用預(yù)先裁剪好的比樣本稍大的Parafilm?封口膜覆蓋樣本。
注意:可將封口膜折起一角以便于取放。封口膜的使用不僅可以確保反應(yīng)混合物的均勻分布,也能減少孵育過程中的液體蒸發(fā)。
4、將切片置于濕盒中于37℃孵育60-90分鐘。
Q:顯色與結(jié)果評斷
A:1、移走Parafilm?封口膜,并將切片置于PBS溶液中室溫孵育1分鐘。
2、輕輕去掉多余液體,換用新鮮的PBS 溶液室溫孵育1分鐘。
3、用濾紙輕輕擦掉樣本周圍及背面的PBS溶液。
注意:為了降低背景,載玻片在用PBS洗一遍之后,可再用含0.1% Triton? X-100和 2mg/ml BSA的PBS洗三次,每次5分鐘,這樣游離的未反應(yīng)的標(biāo)記物可以清除較干凈。
4、洗滌樣本,將載玻片浸入去離子水中,室溫放置5分鐘。重復(fù)兩次,總共洗三次。
可選:用3%BSA PBS封閉樣品,室溫放置20分鐘。
5、滴干載玻片上多余的水并且用吸水紙擦拭細(xì)胞周邊的區(qū)域。
6、用POD稀釋液,配制POD溶液(1:25-50稀釋),在每個(gè)樣本上滴加50uL POD溶液,37℃放置30分鐘。
7、DAB顯色液A和B混合用PBS稀釋成1X工作液。PBS洗滌載玻片3次后,加入50-100uL DAB底物或者其他POD底物,室溫放置10分鐘。
8、PBS洗滌載玻片3次,除去多余底物后,顯微鏡下分析樣本。
二、組織冰凍切片處理流程
Q:操作流程與石蠟包埋組織切片的有何不同之處
A:該操作流程與石蠟包埋組織切片相似,除了將脫蠟步驟替換為固定和短暫的水化步驟,并將蛋白酶K 的處理時(shí)間縮短到10 分鐘。在進(jìn)行該實(shí)驗(yàn)檢測前需固定冰凍組織。為了避免在清洗步驟中的樣本在玻片上損失,建議不用洗瓶清洗,而是將玻片浸在PBS溶液中2-3 次進(jìn)行清洗。
注意:在操作中避免樣本干燥?。?!
Q:組織固定與水化
A:1、將玻片浸沒在4%多聚甲醛溶液(溶于PBS)中,室溫孵育15 分鐘。
2、輕輕去掉多余液體,并用濾紙小心吸干載玻片上樣本周圍的液體。
3、將玻片浸沒在PBS 溶液中,室溫孵育15 分鐘。
4、輕輕去掉多余液體,并用濾紙小心吸干載玻片上樣本周圍的液體。這時(shí)可用疏水筆在樣品周圍描繪樣品分布的輪廓,便于下游透性處理和平衡標(biāo)記操作。
Q:增加樣本通透性
A:將蛋白酶K的處理時(shí)間縮短到10分鐘,其他步驟同于石蠟包埋組織切片處理流程
Q:固定細(xì)胞片處理流程
A:該操作流程與冰凍組織切片相似,除了將蛋白酶K 的處理時(shí)間縮短到5分鐘。將懸浮細(xì)胞固定到玻片上的操作請參考“注意事項(xiàng)”章節(jié)。為了避免在清洗步驟中的樣本在玻片上損失,建議不用洗瓶清洗,而是將玻片浸在PBS溶液中2-3次進(jìn)行清洗。注意:在操作中避免樣本干燥
Q:設(shè)立陽性對照
A:1、DNaseⅠ溶液配置:3000U/ml或者1mg/ml in PBS, 1mM MgSO4 and 1mg/ml BSA
2、取經(jīng)過預(yù)處理(已完成固定和通透性處理)的細(xì)胞,用DNaseⅠ處理,室溫孵育10分鐘
Q:設(shè)立陰性對照
A:在配置E中的標(biāo)記反應(yīng)液時(shí),不加TdT酶
Q:試劑盒組分Biotin-標(biāo)記反應(yīng)混合物(Biotin-LABELING REACTION MIX)的作用
A:Biotin-dUTP和未標(biāo)記的dNTP以最佳的比例混合,在末端脫氧核糖核苷酸轉(zhuǎn)移酶(TdT 酶)的作用下標(biāo)記DNA 3’-OH 末端
Q:試劑盒組分TdT (TdT ENZYME)的作用
A:將標(biāo)記和未標(biāo)記的脫氧核糖核苷酸摻入斷裂的DNA 3’-OH 末端
Q:試劑盒組分POD (25x)的作用
A:SA-HRP,用于結(jié)合Biotin-DNA,并通過HRP催化底物顯色
Q:試劑盒組分POD稀釋液的作用
A:用于稀釋POD
Q:試劑盒組分蛋白酶K濃度
A:1mg/ml
Q:非特異性染色,有些細(xì)胞或組織,核酸或者聚合酶活性水平較高,導(dǎo)致出現(xiàn)非特異性光標(biāo)記
A:取細(xì)胞或組織后立即固定,以阻止這些酶導(dǎo)致假陽性,或者用ddUTP和dATP封閉樣品
Q:非特異性染色,樣品包埋或者固定過程中,由于試劑原因或者方法不當(dāng),造成DNA斷裂
A:更換試劑或者改變包埋固定方法
Q:非特異性染色,TUNEL反應(yīng)時(shí)間過長,或細(xì)胞或組織表面不能保持濕潤,也可能出現(xiàn)非特異性染色
A:注意控制反應(yīng)時(shí)間,或者減少TdT用量(標(biāo)準(zhǔn)量的20-50%),并始終確保樣品濕潤
Q:非特異性染色,內(nèi)源性POD液可能會影響背景
A:在樣品通透處理前,用3%H2O2的甲醇浸泡樣品10分鐘
Q:非特異性染色,POD非特異結(jié)合
A:用3% BSA的PBS封閉樣品,室溫10分鐘,或者POD溶液比標(biāo)準(zhǔn)量稀釋2-3倍后使用
Q:背景很高,支原體污染
A:請使用支原體染色檢測試劑盒檢測是否為支原體污染
Q:背景很高,高速分裂和增殖的細(xì)胞,有時(shí)也會出現(xiàn)細(xì)胞核中的DNA斷裂,產(chǎn)生較多3’-OH 末端
A:凋亡晚期檢測,同時(shí)減少TUNEL反應(yīng)時(shí)間,以提高信噪比
Q:背景很高,TUNEL反應(yīng)過強(qiáng)
A:減少TdT的用量至標(biāo)準(zhǔn)量的20-50%
Q:標(biāo)記效率低,樣品固定時(shí)間過長,導(dǎo)致交聯(lián)程度過高
A:適當(dāng)減少固定時(shí)間,或者采用2%多聚甲醛溶液(溶于PBS)
Q:標(biāo)記效率低,組織樣品通透不足
A:延長孵育時(shí)間,或者提高孵育溫度,嘗試0.1M檸檬酸鈉60℃處理30分鐘
Q:什么是通透性?增加通透性的作用?
A:通透性是破壞細(xì)胞或者組織完整結(jié)構(gòu),使DNA暴漏。
Q:石蠟樣品中,需添加蛋白酶K,蛋白酶K的作用?
A:蛋白酶K在組織樣品通透處理中作用非常關(guān)鍵
Q:POD稀釋液1:25-50稀釋,對于稀釋比例有無建議?
A:初次實(shí)驗(yàn)可以直接1:25稀釋
Q:如何看陽性/陰性對照的結(jié)果?
A:陰性對照為無任何染色,陽性對照為可見大量點(diǎn)狀沉淀
Q:用DAB顯色后會有什么結(jié)果?
A:DAB顯色后會有點(diǎn)狀褐色沉淀
Q:DAB自備是否有什么要求?
A:常規(guī)DAB顯色液即可
Q:DAB顯色背景高
A:DAB顯色沒有過強(qiáng)或者過弱之說,可能出現(xiàn)情況是背景高,背景高的原因是POD濃度過高或者POD反應(yīng)之后洗片子不充分
Q:所用儀器顯微鏡為光學(xué)顯微鏡,沒做過Tunel實(shí)驗(yàn),不知是選擇FITC還是POD
A:根據(jù)所用儀器選擇,如果是熒光顯微鏡建議用FITC的好。另外流式細(xì)胞儀也用FITC,光學(xué)顯微鏡用POD
Q:Tunel (POD)做冰凍切片,固定時(shí)間較長,70度0.5h的抗原修復(fù)但是假陽性太多,是否需要進(jìn)行修復(fù)?一抗是否可4°過夜?
A:TUNEL的原理是dUTP與斷裂的DNA上的3‘OH結(jié)合,不需要做抗原修復(fù);第一次TUNEL反應(yīng)只需37度反應(yīng)1h,或者延長時(shí)間即可。
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