Q:一管式RT-PCR與傳統(tǒng)兩步法區(qū)別
A:7Sea-One Tube RT-PCR(一管式RT-PCR)區(qū)別于傳統(tǒng)的兩步法(逆轉(zhuǎn)錄和PCR擴(kuò)增分兩步完成),RNA模板逆轉(zhuǎn)錄和cDNA擴(kuò)增在一個(gè)管內(nèi)完成,大大降低了污染風(fēng)險(xiǎn)、縮短了分析時(shí)間并且提高了反應(yīng)的重復(fù)性。
Q:擴(kuò)增產(chǎn)物可以做哪些實(shí)驗(yàn)
A:產(chǎn)物可以通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳和EB染色進(jìn)行分析,進(jìn)行下游的常規(guī)操作,例如限制性酶切、連接、DNA測(cè)序、dHPLC分析;或者采用定量PCR儀進(jìn)行qRT-PCR進(jìn)行在線分析。
Q:試劑盒可以應(yīng)用哪些領(lǐng)域
A:1、cDNA克隆(平端連接、限制性酶切、瓊脂糖凝膠電泳/EB染色、熒光毛細(xì)管電泳、DNA測(cè)序等);2、特別適合RNA的qRT-PCR分析;3、RNA病毒或者RNA樣品的定量分析
Q:保真性如何
A:DNA 聚合酶選用熱啟動(dòng) KOD,具有高保真擴(kuò)增特性,產(chǎn)物適用于平端連接。(產(chǎn)物適合平端連接)
Q:反應(yīng)體系
A:以10ul體系為例,在微量離心管中加入以下各種成分
| 反應(yīng)組分 | 體積 |
| 聚合酶 | 0.2ul |
| 2*PCR Buffer | 5ul |
| RNA | 0.5-2ul(1pg-100ng) |
| Primers | 0.5-2ul(各0.4uM) |
| ddH2O | UP to 10ul |
Q:滅菌
A:實(shí)驗(yàn)中盡可能使用一次性的滅菌塑料制品,玻璃容器應(yīng)用0.1% DEPC在37℃處理過(guò)夜,并且高壓滅菌處理,所有的水應(yīng)該用0.1% DEPC 37℃處理過(guò)夜并滅菌
Q:引物用量
A:建議引物用量為終濃度0.2-0.6uM
Q:初次實(shí)驗(yàn),如何設(shè)置RNA模板梯度
A:例如100ng、10ng、1ng、0.1ng、0.02ng總RNA
Q:陽(yáng)性對(duì)照
A:建議每組反應(yīng)用內(nèi)參基因做陽(yáng)性對(duì)照質(zhì)控
Q:反應(yīng)為陰性
A:dNTP容易失效,反應(yīng)為陰性時(shí),建議另外添加0.4mM dNTP
Q:Rnase inhibitor
A:RI可以有效防止RNA降解,并大大提高反應(yīng)的重復(fù)性,建議加入終濃度0.5-1U/ul的RI,特別是微量RNA樣本分析,加入RI的效果非常明顯
Q:PCR反應(yīng)循環(huán)示例
A:典型的一步法RT-PCR,包括第一階段的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)程序設(shè)置和第二階段的PCR擴(kuò)增反應(yīng),例如(該例子為擴(kuò)增400bp片段)
| 45℃,15min | 1cycle |
| 98℃,5min | 1cycle |
| 98℃,15sec | 40 cycles |
| 55℃,20sec | |
| 68℃,20sec | |
| 68℃,3min | 1cycle |
| 4℃,保溫 | 1cycle |
Q:長(zhǎng)片段
A:擴(kuò)增長(zhǎng)片段可適當(dāng)延長(zhǎng)逆轉(zhuǎn)錄時(shí)間(15-25min)和DNA延伸時(shí)間(1kb/min)
Q:延伸溫度
A:延伸溫度可以設(shè)定為52-72℃間,選用68℃延伸溫度,可以較好發(fā)揮KOD活性
Q:擴(kuò)增低豐度模板
A:建議用45個(gè)循環(huán)
本產(chǎn)品僅供科研實(shí)驗(yàn)使用,不用于臨床診斷、治療或病原檢測(cè)。
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